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AMPLIFIED SEQUENCE [5 fiches]

Fiche 1 2012-09-10

Anglais

Subject field(s)
  • Biotechnology
DEF

A short unique DNA sequence(200-500 bp long) that can be amplified by PCR [polymerase chain reaction] and is thus tagged to the site on the chromosome from which it was amplified.

CONT

Short (200 to 500 base pairs) DNA sequence that has a single occurrence in the human genome and whose location and base sequence are known. Detectable by polymerase chain reaction, STSs are useful for localizing and orienting the mapping sequence data reported from many different laboratories and serve as landmarks on the developing physical map of the human genome. ... Expressed sequence tags (ESTs) are STSs derived from cDNAs.

OBS

Glossary in molecular biology (portions of the glossary text were taken directly or modified from definitions in the U.S. Congress Office of Technology Assessment document).

Français

Domaine(s)
  • Biotechnologie
DEF

Site génomique unique défini par un couple d'amorces.

CONT

Il existe deux manières d'utiliser les ADNc pour cartographier les gènes correspondants. La première consiste à utiliser l'ADNc comme sonde, l'autre à dériver à partir de sa séquence un marqueur STS (sequence tagged site, site étiqueté par une séquence). Dans les deux cas, les clones d'ADNc sont étudiés un par un.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Biotecnología
DEF

Secuencia única de ADN corta (200-500 pb) que puede ser amplificada por[reacción en cadena de la polimerasa] y por lo tanto, marcar el lugar del cromosoma donde se amplificó.

OBS

STS por sus siglas en inglés.

Conserver la fiche 1

Fiche 2 2006-07-07

Anglais

Subject field(s)
  • Bioengineering
CONT

Three families of repetitive sequences have been studied in most detail, including the 35-40 bp [base pair] repetitive extragenic palindromic(REP) sequence, the 124-127 bp enterobacterial repetitive intergenic consensus(ERIC) sequence, and the 154 bp BOX element. These sequences appear to be located in distinct, intergenic positions all around the chromosome. The repetitive elements may be present in both orientations on the chromosome, and PCR [polymerase chain reaction] primers have been designed to "read outward" from the inverted repeats in REP and ERIC, and from the boxA subunit of BOX. The use of the above primer(s) and PCR leads to the selective amplification of distinct genomic regions located between REP, ERIC or BOX sequences. The corresponding protocols are referred to as REP-PCR, ERIC-PCR and BOX-PCR, respectively, and rep-PCR collectively. Amplified bands are size fractionated through a gel matrix to yield fingerprint patterns resembling "bar codes", analogous to UPC codes used in grocery stores, and function as a signature for specific bacterial strains.

Français

Domaine(s)
  • Technique biologique
DEF

Technique d'amplification génique effectuée au moyen d'amorces de type BOX afin d'établir l'empreinte génétique d'un microorganisme.

OBS

L'utilisation de l'article semble rare. Par exemple, on parlerait plutôt «d'empreinte génétique par BOX-PCR» que «d'empreinte génétique par la BOX-PCR».

Espagnol

Conserver la fiche 2

Fiche 3 2000-10-19

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics

Français

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

Séquence d'ADN intra- ou extrachromosomique dont le nombre est augmenté par amplification.

Espagnol

Conserver la fiche 3

Fiche 4 1998-02-03

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
OBS

SCAR stands for sequence characterized amplified region.

Terme(s)-clé(s)
  • sequence characterized amplified region marker

Français

Domaine(s)
  • Génétique

Espagnol

Conserver la fiche 4

Fiche 5 1991-07-16

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
CONT

Multiplex DNA sequencing : The increasing demand for DNA sequences can be met by replacement of each DNA sample in a device with a mixture of N samples so that the normal throughput is increased by a factor of N. Such a method is described. In order to separate the sequence information at the end of the processing, the DNA molecules of interest are ligated to a set of oligonucleotide "tags" at the beginning. The tagged DNA molecules are pooled, amplified, and chemically fragmented in 96-well plates. The resulting reaction products are fractionated by size on sequencing gels and transferred to nylon membranes. These membranes are then probed as many times as there are types of tags in the original pools, producing, in each cycle of probing, autoradiographs similar to those from standard DNA sequencing methods.

Français

Domaine(s)
  • Génétique
CONT

La méthode de séquençage multiplex : Plusieurs bibliothèques génomiques sont construites dans des vecteurs plasmidiques contenant chacun une séquence nucléotidique particulière, séquence cible spécifique. Des lots de 20 colonies provenant de chacune des 20 bibliothèques sont alors formés et les plasmides de chaque lot sont purifiés. La digestion enzymatique permet d'exciser les inserts contenant les fragments d'ADN génomique flanqués de leurs deux séquences cibles. Les opérations de séquençage sont alors effectuées selon la méthode chimique de Maxam et Gilbert, et les fragments obtenus sont séparés sur gel de polyacrylamide par électrophorèse. Une sonde correspondant à la séquence caractéristique du vecteur est utilisée pour révéler les fragments issus de ce clone.

Espagnol

Conserver la fiche 5

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