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CATALYSE ENZYMATIQUE [17 fiches]

Fiche 1 2024-10-22

Anglais

Subject field(s)
  • Molecular Biology
CONT

Endolysins are peptidoglycan hydrolases characterized by an enzymatically active domain that catalyzes cell wall breakdown, and a cell wall-binding domain (CBD) that directs the enzymes to their substrates by recognizing specific cell wall-associated ligand molecules.

Français

Domaine(s)
  • Biologie moléculaire
CONT

Les endolysines sont des hydrolases du peptidoglycane caractérisées par un domaine enzymatique qui catalyse la dégradation de la paroi cellulaire et un domaine de liaison à la paroi cellulaire qui dirige les enzymes vers leurs substrats en reconnaissant des molécules de ligand spécifiques associées à la paroi cellulaire.

Espagnol

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Fiche 2 2012-07-03

Anglais

Subject field(s)
  • Biochemistry
  • Analytical Chemistry
CONT

Enzymatic resolution is based on the ability of enzymes (catalytic proteins) to distinguish between R- and S-enantiomers or between enantiotopic pro-R and pro-S groups in prochiral compound.

Français

Domaine(s)
  • Biochimie
  • Chimie analytique
CONT

La résolution enzymatique est une technique dérivée de la résolution cinétique. Le composé permettant la discrimination entre les énantiomères est une enzyme. Cette enzyme catalyse, elle aussi une réaction chimique réversible et, cela, à des vitesses différentes pour chaque énantiomère. Il est possible également que l'enzyme ne catalyse pas la réaction avec un des énantiomères, dans ce cas la technique donne ses meilleurs résultats. La grande différence par rapport à la résolution cinétique est que les enzymes n’ existent que sous une forme qui est spécifiquement plus réactive pour un des énantiomères. De cela, il découle que l'énantiomère qui ne réagit pas doit être isolé en jouant sur ses propriétés chimiques différentes(par extraction ou séparation chromatographique par exemple).

Espagnol

Conserver la fiche 2

Fiche 3 2011-08-09

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

Clinical analysis method where the data are obtained when the concentration is time-dependent. In this case, the data are generally collected from the early linear part of the progress curve which is called the initial velocity (rate).

CONT

In a kinetic method the reaction velocity is measured rapidly; but as a direct consequence of this, the change in the parameter measured, usually absorbance, is very small.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Méthode servant à la détermination de l’activité d’une enzyme ou du dosage d’un substrat ou d’un produit de la réaction. Cette méthode consiste à suivre l’évolution de la réaction en fonction du temps. La mesure se fait en enregistrant la DO en continu, sitôt la réaction déclenchée.

CONT

Une réaction enzymatique n’ est pas un processus se déroulant d’un coup. Trois phases au minimum doivent être considérées :-la rencontre entre substrat et protéine. [...] La deuxième étape, c'est-à-dire la catalyse au sens chimique du terme, est souvent elle-même fragmentée. [...] Les méthodes cinétiques actuelles mettent couramment en évidence deux, trois, voire quatre étapes discrètes successives au-delà de la formation du complexe initial. La dernière étape sera le relargage du ou des produits de la réaction.

Espagnol

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Fiche 4 2011-06-07

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

The unit of enzyme activity proposed by the International Union of Biochemistry in 1964 which represents the amount of an enzyme that will catalyze the transformation of one micromole of substrate in a given time (e.g., one minute) under defined conditions of temperature, pH and substrate concentration.

CONT

A new international unit for enzyme activity recommended by the Enzyme Commission is the katal (abbreviated kat), defined as the amount of enzyme activity that transforms 1 mol s-1 of substrate. The new unit is in accord with the dimensions of rate constants in chemical kinetics, which are based on the second rather than the minute.

OBS

U is an abbreviation for international unit.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Unité d’activité enzymatique correspondant à la quantité d’enzyme qui catalyse la transformation d’une micromole de substrat par minute à 30 degrés et au pH optimal d’activité. Le système international d’unités implique l'utilisation de la mole transformée par seconde comme nouvelle unité, appelée katal.

CONT

Si l’on rapporte le nombre d’unités enzymatiques au poids (en général au mg) de protéine, on a l’activité spécifique (qui évidemment augmente au fur et à mesure de la purification d’un enzyme). L’activité molaire est le nombre de moles de substrat transformé (ou de produit formé) par mole d’enzyme par minute; il faut avoir un enzyme très purifié et de masse moléculaire connue pour pouvoir utiliser ce mode d’expression.

OBS

U.I. est une abréviation d’unité internationale.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
Conserver la fiche 4

Fiche 5 2011-01-12

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

Boundary simulation method eliminates the need to simulate an entire enzyme in a "box" of water; instead one simulates the active site of the enzyme and introduces a boundary region that confines the active-site water molecules and allows an exchange of energy across the boundary between the active site and its surroundings.... The boundary simulation method is now being applied to a number of proteins, including the enzyme ribonuclease, which cleaves ribonucleic acid (RNA) by cutting between two nucleotides, the units that make up a strand of RNA.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

La simulation des bords permet d’étudier la catalyse enzymatique sans prendre en compte tous les atomes de l'enzyme et du solvant qui l'entoure. Dans cette méthode, on ne simule que le site actif de l'enzyme et l'on replace les atomes éliminés par une région frontalière où les molécules d’eau du site actif sont confinées, tout en permettant l'échange d’énergie entre le site actif et son environnement. [...] On a appliqué cette méthode de simulation à un grand nombre de protéines, notamment la ribonucléase, une enzyme qui coupe l'acide ribonucléique(ARN) entre deux nucléotides(les nucléotides constituent les sous-unités de l'ARN).

Espagnol

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Fiche 6 2011-01-10

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

Regulation of enzyme activity. Enzymes may be regulated at two levels: (1) at the level of gene expression and protein synthesis through induction and repression; (2) at the enzyme level through enzyme inhibition or activation as a result of the binding of effector molecules at allosteric sites on the enzyme.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

Deux mécanismes majeurs sont à la base de la régulation de l'activité enzymatique : le contrôle génétique et le contrôle de la catalyse. Le contrôle génétique fait intervenir un changement dans la quantité totale de molécules enzymatiques. Les exemples les plus connus de cette forme de régulation sont l'induction enzymatique et la répression chez les micro-organismes [...]. Le contrôle de la catalyse fait intervenir un changement dans l'activité enzymatique sans que change la quantité totale de l'enzyme synthétisée.

Espagnol

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Fiche 7 2011-01-10

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

An enzyme reaction occurs by the formation of a transitory complex of enzyme and substrate. This occurs at the "active center".... This enzyme-substrate complex, called the Michaelis-Menten complex, decomposes into enzyme and product (or products).

OBS

The enzyme-substrate complex in which the substrate is covalently linked to the enzyme is called "enzyme-substrate compound".

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

Des études cristallographiques ont [...] été effectuées sur des protéines enzymatiques en présence d’analogues de substrats. Elles ont conduit à préciser la position du substrat dans le complexe enzyme-substrat, la nature des interactions entre les deux molécules et l'emplacement exact des groupes catalytiques de la protéine par rapport au substrat, permettant ainsi de proposer des mécanismes plausibles pour la catalyse enzymatique.

Espagnol

Conserver la fiche 7

Fiche 8 2011-01-05

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

Ratio of the space velocity of a catalyst being tested, to the space velocity required for a standard catalyst to give the same conversion as the catalyst under test. In the case of enzymes, it is dependent on temperature, as in the case of ordinary chemical catalysts, but the activity is lost at temperatures above a certain limit due to the denaturation of enzyme protein. Therefore, it is considered that studies on temperature dependence caused by immobilization may provide useful information for comparisons of enzymes and chemical catalysts.

CONT

Most enzymes have molecular weights substantially higher than 17,000 and contain more than one peptide chain. Normally, these polypeptide subunits show no catalytic activity by themselves. It is essential that the subunits be fitted together exactly in a specific, three-dimensional conformation to preserve enzyme activity.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'activité catalytique étant le caractère essentiel de tout enzyme, elle sert à en définir les unités. L'établissement de celles-ci suppose que la réaction catalysée est connue sans ambiguïté, que la quantité de produit formé est mesurable par une méthode analytique fiable, que la réaction est effectuée en présence d’une quantité non limitante de substrat et que l'observation de la réaction porte sur une période suffisamment courte pour que la concentration en substrat puisse y être considérée comme constante et celle du produit comme négligeable. Dans ces condition, l'unité standard ou unité internationale U. I. d’activité enzymatique est la quantité d’enzyme qui catalyse la transformation de 1 micromole de substrat par minute(dans des conditions de milieu, de pH et de température qu'il convient à chaque fois de préciser).

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
DEF

Cociente entre la velocidad espacial que se usa para alcanzar una determinada conversión con un catalizador y la velocidad espacial necesaria para conseguir dicha conversión con un catalizador de referencia.

Conserver la fiche 8

Fiche 9 2011-01-05

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

Promotion of a chemical reaction by addition of a substance or enzyme (catalyst) that partakes in, but is not permanently affected by the reaction. In the case of enzymes, it is mediated by the functional groups found in amino acid side chains and coenzymes. Notably, the amino acid side chains of histidine, serine, cysteine, lysine, glutamate, and aspartate are frequently directly involved in the catalytic process. Coenzymes or metals work in conjunction with enzymes to provide a greater variety of functional groups than is available through amino acid side chains alone.

CONT

DNA technology enables the facile modification of proteins by highly specific mutagenesis of their genes. Enzymes with novel properties may be produced in large quantities from the mutant genes. Kinetic analysis of the mutant enzymes can be combined with high-resolution structural data from protein X-ray crystallography to provide direct measurements on the relationships between structure and function. In particular, the strength and nature of enzyme-substrate interactions and their roles in catalysis and specificity may be studied.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Accélération d’une réaction chimique grâce à la présence, en petite quantité, d’une substance (appelée catalyseur), qui est retrouvée inchangée à la fin de la réaction.

CONT

Certains enzymes subissent une activation irréversible quand ils sont traités par des agents capables de se fixer de façon covalente à un groupement fonctionnel indispensable à la catalyse, ce qui conduit à la formation d’une molécule enzymatique inactive.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
DEF

Proceso por el cual varía la velocidad de una reacción química por la presencia de una sustancia, el catalizador, que al finalizar la reacción permanece inalterada.

Conserver la fiche 9

Fiche 10 2009-02-16

Anglais

Subject field(s)
  • Biochemistry
  • Biological Sciences
DEF

The protein moiety of an enzyme without the cofactor necessary for catalysis. The cofactor may be a metal ion, an organic molecule, or a combination of both.

CONT

Many enzymes require coenzymes to exhibit their catalytic activities. Generally, the binding force between apoenzyme and coenzyme is relatively weak, and reversible separation to give the protein moiety (apoenzyme) and coenzyme can occur easily. Recently, by utilizing this characteristic, purification of apoenzymes has been attempted using coenzymes bound to a water-insoluble carrier... and several reports on the immobilization of coenzymes have been published.

Français

Domaine(s)
  • Biochimie
  • Sciences biologiques
DEF

Un des deux éléments constitutifs des enzymes. C’est la partie activante, protéique, responsable de la spécificité envers le substrat.

CONT

Chez les enzymes de type hétéroprotéique, la fixation du substrat se fait sur la partie protéique, l'apoenzyme, tandis que la catalyse de la réaction est le fait de la partie non protéique, le groupement prosthétique ou le cosubstrat. La partie «apoenzyme» de la molécule enzymatique qui porte le site de fixation du substrat est donc d’abord responsable de la spécificité quant au substrat de l'enzyme. Mais elle peut également intervenir dans la spécificité de réaction et induire un type particulier de réaction. C'est ainsi, par exemple, que dans le métabolisme des acides aminés, le phosphate de pyridoxal peut, suivant l'apoenzyme avec laquelle il se combine, catalyser des réactions soit de transamination, soit de décarboxylation, soit de désamination, soit de racémisation.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Bioquímica
  • Ciencias biológicas
DEF

Proteína de una enzima que requiere un cofactor para ejercer su función.

Conserver la fiche 10

Fiche 11 2003-11-10

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

A topologically separate site of an enzyme which lacks catalytic activity but which can exert regulatory control over the active site.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

Les enzymes allostériques possèdent deux types de site : le site actif qui se combine au substrat et qui catalyse la réaction enzymatique, les sites régulateurs qui peuvent se combiner à un effecteur, soit activateur, soit inhibiteur. Les deux types de site sont séparés sur la molécule. Dans certaines enzymes ils appartiennent même à des chaînes polypeptidiques différentes. La désensibilisation de l'enzyme résulte de l'inactivation des sites régulateurs. [...] Lorsqu'un inhibiteur allostérique se fixe au site allostérique, il se produit aussi une transition allostérique(également réversible), entraînant une modification au niveau du site actif, qui cette fois prend une conformation moins favorable à la fixation du substrat.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
Conserver la fiche 11

Fiche 12 2002-01-17

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
OBS

Ageing occurs, and can be studied, at different levels of complexity from the molecular through the cellular to the organismal. The question of ageing of protein molecules, manifested in the deamidation of asparagine and glutamine residues or conformational changes up to denaturation during their life span is controversial. With some enzymes age-related changes could be detected whereas no such changes were found with others.... In order to arrive at meaningful conclusions it appears necessary to consider the systematic nature of ageing, the alterations in the various macromolecular and enzyme organizational patterns.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'enzyme reste inchangée après la réaction et peut recommencer indéfiniment la même réaction sur une nouvelle molécule. La dénaturation et le vieillissement moléculaire limitent cette durée de vie et constituent le principal goulet d’étranglement à l'utilisation industrielle de la catalyse enzymatique.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
Conserver la fiche 12

Fiche 13 2001-08-08

Anglais

Subject field(s)
  • Chemical Engineering
  • Biotechnology
CONT

The inherent difficulty in the study of enzyme catalysis is that reactions take place enclosed in the active site of the enzyme, so that although the catalytic groups of the enzyme and the reactants are present in high local concentrations they are at least transiently covalently linked and so are part of the same molecule.

Français

Domaine(s)
  • Génie chimique
  • Biotechnologie
CONT

Dans le domaine de la catalyse enzymatique, le Génie Enzymatique concerne l'étude des biocatalyseurs à des fins d’application et, surtout, de production industrielle. L'enzyme n’ est donc pas là considérée comme un sujet d’étude, mais comme un outil technologique permettant de réaliser une transformation donnée dans un milieu défini.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Ingenieria química
  • Biotecnología
Conserver la fiche 13

Fiche 14 1998-01-16

Anglais

Subject field(s)
  • Chemical Engineering
DEF

... in enzyme catalysis, ... molecules reacting per active site in unit time.

Français

Domaine(s)
  • Génie chimique
DEF

[...] en catalyse enzymatique, [...] nombre de molécules qui réagissent par site actif et par unité de temps.

Espagnol

Conserver la fiche 14

Fiche 15 1992-08-21

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
OBS

Reactors. The most widely applied reactors for gasification of biomass are the moving bed types and the fluidized bed types .... Moving bed-counter current. The moving bed reactor is a vertical shaft through which the biomass flows slowly downwards as a packed bed. The reactor has a gastight feeding system at the top and an ash removal system at the bottom. The moving bed reactor is used for biomass having dimensions of 1 to 10 cm. Three sub-types can be distinguished: cocurrent, countercurrent and cross-current reactors. The countercurrent moving bed gasifier is the most simple reactor type. The gas, produced in the reduction zone, leaves the reactor together with the pyrolysis products and the steam from the drying zone. The producer gas is rich in hydrocarbons and it has a temperature of about 400°C. The gas can be used for direct heating purposes. If it is to be used for electricity generation by internal combustion engines, it has to be cleaned thoroughly.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

(...) réacteurs(...) dans lesquels les flux d’alimentation et de sortie circulent en sens inverse de part et d’autre de la membrane, [et qui] réalisent simultanément la catalyse enzymatique et la purification du produit.

OBS

(...) les supports membranaires peuvent équiper des réacteurs de conceptions technologiques très diverses. Dans certains cas, la membrane constitue une simple barrière physique retenant les macromolécules dans le compartiment réactionnel : c’est le principe des membranes d’infiltration utilisées pour récupérer le biocatalyseur dans les réacteurs agités (...)

Espagnol

Conserver la fiche 15

Fiche 16 1990-01-16

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

The problem of enzyme stabilisations ... is primarily concerned with restraining the enzyme from adopting other conformations than those that are optimal for (a) mutual access of substrate to its binding site on the enzyme (b) the continued ability of the enzyme to express its catalytic activity on the substrate at its active site and (c) the ability for the product or products of the reaction to freely diffuse, or be repelled from the binding site.

OBS

There exist many cases when the use of a stabilizing polymeric carrier can dramatically affect the biological activity of enzymes: for example, their interaction with high-molecular-weight substrates or with cell surface receptors. Methods of enzyme stabilization also are available that do not require carriers, but instead depend on chemical modification or intramolecular crosslinking with bifunctional reagents.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

Les axes futurs les plus intéressants de la technologie enzymatique sont les suivants :-utilisation des propriétés non conventionnelles des enzymes;-élucidation des mécanismes moléculaires de l'inactivation enzymatique amenant au développement d’approches rationnelles de la stabilisation des enzymes;-catalyse enzymatique en présence de solvants organiques dans des conditions extrêmes;-conception de nouvelles molécules ayant des propriétés catalytiques par mutagénèse dirigée.

Espagnol

Conserver la fiche 16

Fiche 17 1990-01-16

Anglais

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

The water activity exerts a strong influence on enzyme activity and stability. This phenomenon must be fully appreciated in order to analyze the effect of a compound on enzyme efficiency, and so as not to misinterpret as direct an indirect effect caused by a modification of water activity. Furthermore, from a technological viewpoint, a better understanding of this phenomenon may allow rationalization of the operation of enzyme catalysts and their improved efficiency.

Français

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'efficacité enzymatique est étonnante : ce type de catalyse multiplie par un facteur compris en général entre 106 et 1010 la vitesse d’une réaction, ce qui est énorme. Au niveau moléculaire, le problème est de savoir grâce à quels phénomènes intimes l'obtention de telles accélérations est possible. Quatre mécanismes principaux méritent d’être évoqués : les effets de positionnement et de proximité, la catalyse covalente, la catalyse acide-base, les contraintes conformationnelles.

Espagnol

Conserver la fiche 17

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