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ELECTROPHORESE GEL GRADIENT DENATURANT [6 fiches]

Fiche 1 2013-07-18

Anglais

Subject field(s)
  • Biochemistry
CONT

High-resolution HLA-DRB [human leucocyte antigen-5,6-dichloro-furanosyl-benzimidazole riboside] typing is required for bone marrow transplantation between unrelated donors and recipients and also for identification of novel HLA-DRB alleles. Here we describe a method for the unambiguous identification of HLA-DRB alleles using the polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) and direct sequencing.

Français

Domaine(s)
  • Biochimie

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Bioquímica
DEF

Método de electroforesis para separar fragmentos de ADN del mismo tamaño en función de su secuencia.

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Fiche 2 2012-09-26

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
  • Bioengineering
CONT

Heteroduplex is double-stranded DNA in which the two DNA strands do not show perfect base complementarity. When DNA is denatured, the two strands are separated. On renaturation or annealing, complementary DNA strands reassociate and form a homoduplex. However, when there is a mutation in one of the strands then a heteroduplex is formed. The electrophoretic mobility of heteroduplex in polyacrylamide gel is less than that of homoduplex, and they can be detected as an extra slow moving bands. Resolution is better in specially formulated gel matrices (Hydro-link, MDE, etc.). In fragments of under 200 bp insertions, deletions and most single base substitutions are detected. Heteroduplex analysis is mostly used combined with single confirmation analysis (SSCA) on a single gel.

Français

Domaine(s)
  • Génétique
  • Technique biologique
CONT

Nous présentons les avantages relatifs d’une stratégie de recherche spécifique des mutations qui introduisent une signal d’arrêt prématuré de la synthèse protéique fondée sur le test de troncation des protéines(PTT), par rapport aux techniques classiques de balayage d’un fragment d’ADN ou d’ARN telles que l'électrophorèse en gel de gradient dénaturant(DGGE), l'analyse d’hétéroduplex(HA), l'analyse de conformation de l'ADN en simple brin(SSCA) ou le clivage chimique ou enzymatique de mésappariements(CCM/EMC).

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Genética
  • Bioingeniería
DEF

Empleo de la movilidad electroforética del ADN heterodúplex para estimar el grado de no homología entre las secuencias de las dos hebras.

OBS

La movilidad en gel tiende a reducirse a medida que aumenta la divergencia entre secuencias, dado que el tamaño efectivo de un par de hebras totalmente complementarias es menor que el de una estructura donde la complementación es parcial.

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Fiche 3 2012-09-18

Anglais

Subject field(s)
  • Biochemistry
  • Biotechnology
DEF

A type of electrophoresis used to determine the size and composition of proteins.

OBS

Electrophoresis carried out in acrylamide gel, often used for the study of individual proteins in serum, particularly genetic variants and enzymes. Three gel layers are constructed, differing in composition and pore size: separation gel, spacer gel, and bottom separation gel. The actual ion separation is based on the charge and molecular size and takes place in the bottom gel layer.

Français

Domaine(s)
  • Biochimie
  • Biotechnologie
CONT

La température de fusion d’un produit PCR(ADN double brin), c'est-à-dire la température moyenne de séparation des deux brins est fonction de sa séquence. Une mutation ponctuelle qui change donc la séquence entraîne une modification de la température de fusion. Cette modification est mise en évidence par électrophorèse sur gel de polyacrylamide en présence d’un gradient d’agent dénaturant.

OBS

La plus fine des méthodes de séparation par simple électrophorèse sur support. Une solution d’acrylamide forme un gel par polymérisation. Les pores ont un diamètre de 50 [angstrom] environ. Les protéines à séparer sont déposées à une extrémité du gel dans lequel elles se déplacent sous l’action du champ électrique.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Bioquímica
  • Biotecnología
DEF

Método [...] para separar ácidos nucleicos y proteínas atendiendo a su tamaño molecular [...], se basa en la migración de moléculas cargadas eléctricamente a través de una matriz inerte (gel de poliacrilamida) como resultado de la aplicación de un campo eléctrico.

OBS

PAGE por sus siglas en inglés.

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Fiche 4 2010-04-22

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
  • Biochemistry
CONT

Chemical Mismatch Cleavage (CMC) is often referred to as Chemical Cleavage of Mismatch (CCM), Amplification Mismatch Detection (AMD), Hydroxylamine Osmium tetroxide method (HOT); and is a method for searching for the presence of unknown mutations.

Français

Domaine(s)
  • Génétique
  • Biochimie
CONT

Nous présentons les avantages relatifs d’une stratégie de recherche spécifique des mutations qui introduisent un signal d’arrêt prématuré de la synthèse protéique fondée sur le test de troncation des protéines(PTT), par rapport aux techniques classiques de balayage d’un fragment d’ADN ou d’ARN telles que l'électrophorèse en gel de gradient dénaturant(DGGE), l'analyse d’hétéroduplex(HA), l'analyse de conformation de l'ADN en simple brin(SSCA) ou le clivage chimique ou enzymatique de mésappariements(CCM/EMC).

Espagnol

Conserver la fiche 4

Fiche 5 1999-10-22

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
  • Bioengineering
CONT

Currently, the multiplex PCR products are frequently used in efforts trying to identify point mutations. The techniques applied include single-strand conformation analysis (SSCA), hetero-duplex analysis (HD) and double-strand conformation analysis (DSCA). With these technologies, polymorphisms can be detected in frequent and in rare polymorphisms.

Français

Domaine(s)
  • Génétique
  • Technique biologique
CONT

Nous présentons les avantages relatifs d’une stratégie de recherche spécifique des mutations qui introduisent une signal d’arrêt prématuré de la synthèse protéique fondée sur le test de troncation des protéines(PTT), par rapport aux techniques classiques de balayage d’un fragment d’ADN ou d’ARN telles que l'électrophorèse en gel de gradient dénaturant(DGGE), l'analyse d’hétéroduplex(HA), l'analyse de conformation de l'ADN en simple brin(SSCA) ou le clivage chimique ou enzymatique de mésappariements(CCM/EMC).

Espagnol

Conserver la fiche 5

Fiche 6 1999-10-22

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
CONT

A number of methods are available that can detect known DNA mutations e.g. Allele specific amplification/hybridisation(ASA/H), Oligonucleotide ligation assay (OLA), and mini-sequencing just to mention a few. A common drawback for all of these methods is that they only detect mutations known in advance i.e. mutations outside the small area of detection will go undetected. If the position or nature of mutations is unknown then one must define the type of information required :Screening: Is there a mutation or not? SSCP, DGGE ... How many and where are they localised? EMC (Enzymatic Mutation Cleavage)...and CCM (Chemical Cleavage by Mismatch).

Français

Domaine(s)
  • Génétique
CONT

Nous présentons les avantages relatifs d’une stratégie de recherche spécifique des mutations qui introduisent une signal d’arrêt prématuré de la synthèse protéique fondée sur le test de troncation des protéines(PTT), par rapport aux techniques classiques de balayage d’un fragment d’ADN ou d’ARN telles que l'électrophorèse en gel de gradient dénaturant(DGGE), l'analyse d’hétéroduplex(HA), l'analyse de conformation de l'ADN en simple brin(SSCA) ou le clivage chimique ou enzymatique de mésappariements(CCM/EMC).

Espagnol

Conserver la fiche 6

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