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DDRT-PCR [2 fiches]

Fiche 1 2012-08-29

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
CONT

Differential Display (DD) ... and a conceptually similar technique, arbitrarily primed PCR fingerprinting of RNA (APPCR)19, both PCR amplify subsets of an mRNA population and separate the resulting cDNAs by denaturing polyacrylamide gel electrophoresis. Since the introduction of DD in 1992, over 100 reports regarding improvements and/or successful applications have been published. Although DD has the appearance of being technically easy, the road from "band on the gel" to a positive can be treacherous as outlined in a recent commentary. The primary criticisms are (1) a high false positive rate, (2) questioned ability of DD to identify both abundant and rare mRNAs, (3) coding regions of mRNAs are usually not cloned, and (4) verification process is time consuming and usually requires a fair amount of RNA.

Français

Domaine(s)
  • Génétique
CONT

En 1992, deux chercheurs du Dana Farber Cancer Institute de Boston (États-Unis), P. Liang et AB Pardee, présentent une nouvelle méthode, le «differential display» (DD) - ou DDRT-PCR (DD reverse transcription polymerase chain reaction) qui permet une étude directe des modifications de l'expression génique [...] P. Liang et AB Pardee ont démontré que la combinaison d'amorces arbitraires et d'amorces spécifiques des ARNm permet de générer un set de fragments d'ADNc représentatifs des ARNm d'une cellule. Dans des conditions appropriées, le profil des fragments dérivés d'un type cellulaire est reproductible et peut être comparé à celui des fragments d'un autre type cellulaire. L'étude directe de l'expression différentielle des gènes devient possible.

OBS

Outil d'expression génique.

Espagnol

Campo(s) temático(s)
  • Genética
DEF

Método para identificar ARNm que se encuentra a diferentes concentraciones en diferentes tejidos o en respuesta a tratamientos específicos.

OBS

Los ARNm se convierte a ADNc; una determinada proporción de estos ADNc se amplifican por la reacción en cadena de la polimerasa y se separan por electroforesis.

Conserver la fiche 1

Fiche 2 1998-11-24

Anglais

Subject field(s)
  • Genetics
CONT

Differential Display is a powerful technique for identifying and isolating genes that display modulation under a given stimulus or environmental perturbation. The DDRT-PCR Kit from Display Systems Biotech provides a comprehensive protocol and complete set of reagents to perform this process in your own lab. Despite the widespread acceptance of the DDRT-PCR Kit as a gene discovery tool, the protocols remain labor-intensive and can take several weeks to obtain the desired results. Because Display Systems Biotech performs DDRT-PCR on a routine basis you can save time and avoid pitfalls inherent in the complex procedure (that often lead to a high level of false positives) by allowing us to perform the procedure for you; we guarantee results.

Français

Domaine(s)
  • Génétique
OBS

Nous cherchons à identifier et à caractériser des gènes de suppression tumorale impliqués dans la progression du cancer de la prostate. Nous avons utilisé la fusion de microcellules pour transférer une portion du chromosome 12 (nommé del(12)(q13) dans une lignée cellulaire cancéreuse humaine (DU145). Les hybrides cellulaires obtenus ne sont plus tumorigéniques lorsqu'injectés chez la souris nue. Ceci suggère la présence de gènes de suppression tumorale sur ce chromosome. Les protéines traduites de ces gènes auraient donc un effet inhibiteur sur l'établissement de tumeurs prostatiques. Nous avons utilisé une méthode de criblage différentiel (DDRT-PCR) pour identifier les ADN complémentaires exprimés préférentiellement dans les hybrides non tumorigéniques qui contiennent del(12)(q13). Ces ADN complémentaires furent isolés, réamplifiés, clonés et séquencés. Des analyses de types Northern démontrent une hausse d'expression de certains ARNm dans les hybrides non tumorigéniques. Nous concluons que certains de ces gènes peuvent jouer un rôle important dans la progression des adénocarcinomes prostatiques.

Espagnol

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