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HYDROGEN BONDING [11 records]

Record 1 2025-06-23

English

Subject field(s)
  • Chemistry
CONT

Hydrophilicity means that polar functional groups molecules combine with water molecules through electrostatic interaction or hydrogen bonding...

French

Domaine(s)
  • Chimie
DEF

Propriété d'une substance polaire ou chargée à forte affinité pour l'eau.

Spanish

Save record 1

Record 2 2013-01-31

English

Subject field(s)
  • Genetics
DEF

A pair of nucleotides in the complementary strands of a [nucleic acid] molecule that interact through hydrogen bonding across the axis of the helix.

OBS

Because DNA is double-stranded, the lengths of molecules are described as so many base pairs (bp).

OBS

[In general,] lengths of RNA molecules [are not] expressed in bp because most RNAs are single-stranded.

OBS

[In DNA,] one of the nucleotides in each pair is a purine (either adenine or guanine), and the other is a pyrimidine (either thymine or cytosine). Because of their spatial configuration, adenine always pairs with thymine, and guanine always pairs with cytosine.

French

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

Dans un [acide nucléique] double brin, paire de nucléotides complémentaires utilisé comme unité de mesure de la longueur d'une séquence.

OBS

[En général,] la longueur des molécules d'ARN [n'est pas] exprimée en paires de bases, car [la majorité de] ces molécules sont à simple brin.

OBS

paire de bases : terme normalisé par l'AFNOR.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Genética
Save record 2

Record 3 2013-01-22

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
DEF

The folding of part of a polypeptide chain into an ordered structure such as a α-helix [alpha-helix] or ß-pleated [beta-pleated] sheet; it is the result of hydrogen bonding between adjacent segments of the chain.

CONT

Secondary structure prediction has been a reasonably successful approach in polypeptide design. Choice of amino acid sequence was aimed at achieving the proposed folding and to form a sufficient number of specific non-covalent bonds with a particular ligand.

OBS

Although the term usually is applied to proteins, it can be applied to other polymers, e.g., the cloverleaf structure of transfer RNA.

OBS

The distinction between secondary and tertiary structure is somewhat arbitrary.

French

Domaine(s)
  • Biochimie
DEF

Élément structural d'une chaîne polypeptidique, qui peut adopter deux conformations principales, hélice α et feuillet ß, stabilisées par des liaisons hydrogène entre l'oxygène d'un carbonyle et l'hydrogène d'un amide, de même qu'entre les chaînes latérales des aminoacides.

CONT

Les protéines globulaires sont, en moyenne, formées d'environ 350 acides aminés et leur chaîne principale peut se replier d'innombrables façons. Le nombre de niveaux de structure différents montre à quel point la variété règne. Tout d'abord, les interactions locales entre des acides aminés voisins sont à l'origine de la formation des hélices alpha, des feuillets bêta ou d'autres types de structures secondaires; ces structures, formant des blocs assez bien définis, s'organisent en domaines; enfin la disposition des domaines les uns par rapport aux autres produit la structure tertiaire. L'existence des mêmes structures secondaires et des mêmes domaines, dans de nombreuses protéines différentes, prouve que [...] toutes ces structures semblent jouer un rôle fondamental dans l'évolution et la diversification des protéines.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Bioquímica
DEF

Conformación tridimensional que adoptan las macromoléculas, en particular los ácidos nucleicos y los polipéptidos.

OBS

Su formación resulta de la acción de fuerzas no covalentes generadas por interacciones entre residuos próximos. Algunos ejemplos son la hélice alfa y la hoja plegada beta de las proteínas y los bucles en horquilla de los ácidos nucleicos.

Save record 3

Record 4 2011-11-02

English

Subject field(s)
  • Chemistry
CONT

The "bonding number" of a neutral heteroatom in the corresponding unsubstituted parent compound is defined as the sum of the total number of bonds to adjacent skeletal atoms, if any, and the number of hydrogen atoms attached to it, if any.

French

Domaine(s)
  • Chimie
DEF

Nombre total de liaisons à deux électrons qu'un atome d'un hydrure fondamental peut contracter avec les atomes adjacents, y compris ceux d'hydrogène.

OBS

indice de valence formelle : terme et définition publiés au Journal officiel de la République française le 8 octobre 2003.

Spanish

Save record 4

Record 5 2011-01-10

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

A fine-structure analysis of the tyrosyl-tRNA synthetase from Bacillus stereothermophilus is revealing the subtle roles of hydrogen bonding in catalysis and specificity. Modification of the residues that hydrogen-bond with ATP and tyrosine shows how the energetics must be analysed in terms of an exchange reaction with solvent water. Based on this idea, and structural data, an enzyme of vastly improved enzyme-substrate affinity has been engineered.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'affinité d'un enzyme pour un substrat est égale à 1/Km. Si Km est élevé (il faut donc une concentration élevée en substrat pour avoir une vitesse égale à Vmax/2) l'affinité est faible; si Km est faible, l'affinité est grande (il suffit d'une faible concentration en substrat pour avoir une vitesse égale à Vmax/2).

OBS

Lorsqu'un activateur allostérique se fixe au site allostérique, il s'ensuit une légère modification de la conformation de l'enzyme -- appelée transition allostérique -- (d'ailleurs réversible), qui entraîne une modification de la conformation au niveau du site actif (catalytique). Ce site acquiert une conformation plus propice à la fixation du substrat, il y a augmentation de l'affinité de l'enzyme pour le substrat (Km' <Km).

Spanish

Save record 5

Record 6 2010-09-15

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

Triggered conformational changes... are the motions of groups of atoms(i. e. individual side-chains) or whole sections of a protein(i. e. loops of chain, domains of secondary and tertiary structure, or subunit), which occur as a response to a specific stimulus. The distance moved can be as much as 10 [angstrom unit] or more. The time scale can be estimated by studies of the rate of binding or turnover reactions. The energy for triggered conformational change comes from specific interactions, such as electrostatic attractions or hydrogen bonding interactions. The best-known example of a triggered conformational change is the transition in tertiary structure that occurs when ligands bind to the iron atoms of hemoglobin.

OBS

The types of substances whose binding can trigger a specific conformational change include substrates (dihydroxyacetone phosphate in triose phosphate isomerase), coenzymes (NAD binding to lactate dehydrogenase), allosteric effectors (CTP and ATP in aspartic transcarbamylase), inhibitors (statine-containing polypeptide inhibitors of acid proteases) and even protons (the Bohr effect in hemoglobin; pH-dependent conformational changes in adenylate kinase).

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Modification de la conformation des protéines provoquée par la fixation de ligands à leur surface. Parmi ces ligands, notons les substrats, activateurs, inhibiteurs et coenzymes.

Spanish

Save record 6

Record 7 2005-02-04

English

Subject field(s)
  • Chemical Engineering
  • Biological Sciences
  • Immunology
DEF

Weak bond, primarily electrostatic, between an electronegative atom within a given molecule and a hydrogen atom attached to another electronegative atom.

CONT

The intermolecular attractive forces binding antigen to antibody.... Hydrogen bonding results from the formation of hydrogen bridges between appropriate atoms.

French

Domaine(s)
  • Génie chimique
  • Sciences biologiques
  • Immunologie
DEF

Type de liaison moléculaire où l'hydrogène établit un pont entre deux atomes fortement électronégatifs (azote, oxygène). Dans les macromolécules, elle assure le maintien de la structure. Ce type de liaison se répète un grand nombre de fois tout le long de la molécule concernée.

CONT

Les forces unissant antigène et anticorps sont de quatre types. [...] Les liaisons hydrogène sont des liaisons de faible énergie (0, 5 à 2 kcal/mole) entre atomes électropositifs (hydrogène) et atomes électronégatifs (oxygène ou azote). La stabilité de ces liaisons dépend de la présence de molécules d'eau. Elle augmente quand la température diminue.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Ingenieria química
  • Ciencias biológicas
  • Inmunología
Save record 7

Record 8 2003-12-17

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

One method used to assess the effect of ions on protein conformation is to measure the melting temperature (Tm) which is the midpoint of the reversible folding ... unfolding transformation or order = disorder transformation. It can be illustrated by the thermally induced conversion of collagen from the triple helical order form to the disordered random coil conformation where Tm is the temperature at which the helical and the coil forms are equally stable. Tm decreases by about 16[degrees c] per mole if calcium chloride is added and is approximately linear with molarity. The transformation can be followed by a plot of change in optical rotation against temperature.

OBS

Ions can potentially affect the three major factors namely hydrogen bonding, hydrophobic bonds and electrostatic interaction, that hold an enzyme in an optimal conformation.

OBS

The term Tm should read T[subscript]m.

OBS

Because of technical constraints, the formula(s) given in CBT-167 could not be reproduced.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Température à laquelle la moitié des molécules ont subi une transformation réversible de type déploiement de chaîne ou dénaturation.

OBS

Ce terme est aussi employé pour désigner le point médian de la variation de température nécessaire pour séparer les deux brins d'une molécule d'ADN

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
Save record 8

Record 9 2003-11-21

English

Subject field(s)
  • Atomic Physics
  • Industrial Techniques and Processes
  • Chemistry
DEF

An analytical technique analogous to x-ray diffraction in which an incident beam of neutrons is scattered by the atoms of a crystal.

CONT

Because elements that are close to each other in the Periodic Table differ considerably in their neutron-scattering ability, neutron diffraction is capable of distinguishing between them. For example, carbon nitrogen, and oxygen atoms can be readily identified by neutron diffraction, where as they appear almost identical by the x-ray method. More accurate determination of the bond lengths of light atoms and distribution of molecular bonding electrons is also possible. Details of molecular structure that can only be inferred by other techniques can often be observed directly by neutron diffraction. Investigations using this method include hydrogen bonding, so-called metal cluster compounds(C. H. M relationships) and electronic charge distributions.

French

Domaine(s)
  • Physique atomique
  • Techniques industrielles
  • Chimie
CONT

En réalité la seule méthode capable de déceler la structure atomique de la plupart des macromolécules est la diffraction des rayons X par des cristaux. [...] La diffraction neutronique est surtout utilisée pour placer les atomes d'hydrogène, trop légers pour être normalement détectés par diffraction des rayons X, dans des modèles atomiques obtenus par cette dernière méthode.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Física atómica
  • Procesos y técnicas industriales
  • Química
DEF

Difracción de los neutrones térmicos que por tener una longitud de onda asociada aproximadamente igual a la distancia entre los átomos de los cristales, son difractados por éstos.

Save record 9

Record 10 1994-06-23

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
CONT

Starch is supplied as a white, granular powder which is insoluble in cold water because of the polymeric structure and hydrogen bonding between adjacent chains. However, when an aqueous suspension is heated, the water is able to penetrate the granules and causes them to swell, producing a "gelatinized" solution or paste, depending on the concentration. Cooling this hot solution causes thickening, which is called "setback".

French

Domaine(s)
  • Biochimie
CONT

Les nombreux groupes hydroxyles libres (OH) de la molécule d'amidon déterminent le comportement du polymère en solution aqueuse car ils ont tendance à former des liaisons hydrogène entre les chaînes de polysaccharides, cela empêchant la solution des dispersions de l'amidon en cas de refroidissement ou de congélation. Cette réaction intermoléculaire est le mécanisme sous-jacent de la rétrogradation, un processus indésirable modifiant la texture et la stabilité (donc l'acceptabilité) de nombreux produits alimentaires contenant de l'amidon.

Spanish

Save record 10

Record 11 1982-12-12

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
DEF

The coiled conformation of a polypeptide which is maintained by hydrogen bonding between the CO and NH groups of the peptide bonds of adjacent coils; in natural polypeptides the helix is right-handed.(Gk helix coil).

French

Domaine(s)
  • Biochimie
DEF

Configuration spatiale de nombreuses protéines, caractérisée par une disposition des acides aminés constitutifs selon une hélice dont le pas est de 0,51 à 0.54 nm. Cette disposition hélicoïdale assure une solide cohésion moléculaire grâce à des liaisons hydrogènes entre les spires successives de l'hélice.

Spanish

Save record 11

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