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MODIFICATION ENZYME [17 records]

Record 1 2011-08-09

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

Chemically reactive compound that is designed to resemble a substrate of an enzyme, so that it binds specifically to the active site and forms covalent bonds with the protein residues.

CONT

The reaction of an affinity label with an enzyme involves the initial formation of a reversibly bound enzyme-inhibitor complex followed by covalent modification and hence irreversible inhibition.... Affinity labels are very useful for identifying catalytically important residues and determining their pKa, values from the pH dependence of the rate of modification.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Analogue de substrat qui, se combinant au site actif, pourrait y subir un métabolisme normal, mais qui, au moment voulu choisi par l'expérimentateur, se combine irréversiblement avec un acide aminé du site.

CONT

Un marqueur d'affinité (...) le N-tosyl L- phénylalanylchlorométhyl-cétone (TPCK), a été synthétisé pour ressembler à un substrat normal de la chymotrypsine. (...) L'incubation du TPCK avec la chymotrypsine provoque son attachement au site actif, de la même façon que le substrat normal. Mais, au lieu de l'hydrolyse du substrat on obtient l'alkylation de l'histidine 57, résidu essentiel; ceci indique que cette histidine se trouve proche de la liaison normalement hydrolysée.

Spanish

Save record 1

Record 2 2011-05-16

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

The extraction of an unknown substance in pure form from a mixture.

CONT

The field of Enzyme Technology encompasses large scale enzyme production, enzyme isolation affinity chromatography, enzyme modification, and practical applications of enzymes... The terms, "isolation" and "purification" will relate to the other techniques involved in obtaining a pure, or specified, product... The isolation and purification of enzymes is very often accompanied by considerable loss of activity.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Action de dégager un élément de ses combinaisons, un corps pur d'un mélange.

CONT

Les premières techniques d'isolement des protéines étaient empiriques, lentes et laborieuses. Toutefois, avec les nouvelles méthodes [...] l'isolement des protéines devient un art raffiné. Il n'y a pas de procédé unique ou d'ensemble de procédés grâce auxquels une ou deux protéines quelconques puissent être isolées; mais, pour chaque protéine, il est possible de choisir une séquence d'étapes de séparation qui donnera un degré élevé de purification et un bon rendement. L'objectif général est d'augmenter la pureté ou l'activité biologique de la protéine désirée par unité de poids, sans la rendre inactive, et en même temps d'augmenter considérablement le rendement.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
Save record 2

Record 3 2011-01-12

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
  • Biotechnology
DEF

Positively charged resin used in ion-exchange chromatography to which diethylaminoethyl groups have been attached.

CONT

Although some of the earliest reports on immobilising enzymes refer to inorganic supports, in the next phase of development organic polymers were favoured. This was probably due both to the rapid development of interest in enzyme structure and the chemical modification of enzymes, and to the ease with which enzymes could be attached to organic polymers such as cellulose. This was achieved by adsorption(to DEAE-cellulose), and by covalent bonding.... Glucose isomerase has been immobilized through sorption from water solutions by anion exchange celluloses such as diethylaminoethyl(DEAE) cellulose and... pyruvate kinase bound to diethylaminoethylcellulose(DEAE-cellulose) via cyanuric chloride.

Key term(s)
  • diethylaminoethyl cellulose
  • DEAE-cellulose

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
  • Biotechnologie
DEF

Cellulose chargée positivement utilisée comme échangeuse d'anions dans la séparation chromatographique des protéines.

CONT

Les protéines peuvent être fractionnées grâce à la chromatographie par échange d'ions. On utilise souvent dans ce but des celluloses modifiées qui sont, soit des échangeurs d'anion comme la diéthylaminoéthyl-cellulose (DEAE-cellulose), soit des échangeurs de cations comme la carboxyméthyl-cellulose (CM-cellulose).

Key term(s)
  • DEAE-cellulose
  • cellulose diéthylaminoéthylique

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
  • Biotecnología
Save record 3

Record 4 2011-01-11

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

The factors which contribute to the irreversible denaturation of soluble enzymes(aggregation, autolysis, etc.) are different from the factors likely to be responsible for irreversible denaturation of proteins... As a rule, denaturation of enzymes induced by elevated temperature, extreme pH values, or organic solvents can only be irreversible as a result of secondary processes, e. g., aggregation, chemical modification of functional groups, autolysis or degradation induced by admixtures of other enzymes, or breakage of the native disulphide bonds.... It is likely that the denatured immobilized enzyme may adopt an incorrect conformation upon removal of the denaturing conditions. In these circumstances it is proposed that subsequent denaturation and renaturation under controlled conditions may permit the immobilized enzyme to refold and renature to the correct conformation.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'énergie nécessaire pour faire apparaître l'inactivation est très élevée, ce qui est interprété par la nécessité de rompre simultanément plusieurs liaisons pour déterminer une inactivation irréversible. La courbe d'activité de l'enzyme en fonction de la température est donc composite (en forme de cloche) : le sommet expérimental de cette courbe représente en fait un domaine d'instabilité entre dénaturation réversible et dénaturation irréversible, si bien qu'il n'y a pas de température optimale pour une réaction enzymatique.

Spanish

Save record 4

Record 5 2011-01-11

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

The most commonly employed method for preparing water-insoluble enzyme derivatives is through intermolecular crosslinking of enzyme molecules with multifunctional reagents.... This immobilization method is based on the formation of chemical bonds, as in the covalent binding method, but water-insoluble carriers are not used in this method.... The correct choice of reaction conditions is indeed one of the major considerations in dealing with the chemical modification of proteins with multifunctional reagents for producing water-insoluble enzyme derivatives. The concentration of the enzyme and the reaent, the pH and ionic strength of the solution, etc. must be chosen carefully so as to be favorable for intermolecular crosslinking between enzyme molecules.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

Dans la technique de réticulation [...] les molécules d'enzyme sont liées entre elles par pontages intermoléculaires, faisant intervenir des agents bi ou multifonctionnels. On obtient ainsi des structures de très haut poids moléculaire. Par exemple, coréticulation par l'hexaméthylènediisothiocyanate. Les structures ainsi préparées peuvent être incluses dans un gel.

OBS

On relève parfois d'importantes baisses d'activité de l'enzyme dues à l'établissement d'interactions entre macromolécules, du fait de leur proximité spatiale. Pour remédier à cet inconvénient, il est possible de diluer l'enzyme, par des molécules protéiques non actives, albumine, fibrinogène ou hémoglobine, qui évitent un contact trop étroit entre les molécules du biocatalyseur.

Spanish

Save record 5

Record 6 2011-01-10

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

A fine-structure analysis of the tyrosyl-tRNA synthetase from Bacillus stereothermophilus is revealing the subtle roles of hydrogen bonding in catalysis and specificity. Modification of the residues that hydrogen-bond with ATP and tyrosine shows how the energetics must be analysed in terms of an exchange reaction with solvent water. Based on this idea, and structural data, an enzyme of vastly improved enzyme-substrate affinity has been engineered.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'affinité d'un enzyme pour un substrat est égale à 1/Km. Si Km est élevé (il faut donc une concentration élevée en substrat pour avoir une vitesse égale à Vmax/2) l'affinité est faible; si Km est faible, l'affinité est grande (il suffit d'une faible concentration en substrat pour avoir une vitesse égale à Vmax/2).

OBS

Lorsqu'un activateur allostérique se fixe au site allostérique, il s'ensuit une légère modification de la conformation de l'enzyme -- appelée transition allostérique -- (d'ailleurs réversible), qui entraîne une modification de la conformation au niveau du site actif (catalytique). Ce site acquiert une conformation plus propice à la fixation du substrat, il y a augmentation de l'affinité de l'enzyme pour le substrat (Km' <Km).

Spanish

Save record 6

Record 7 2011-01-10

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

Attractive and repulsive electrical forces between charged particles - atoms, and/or groups of atoms, and/or molecules - that are caused both by the presence of ionized species and by the electropositive and electronegative properties of the atoms.

CONT

Information on changes of enzymatic properties caused by the immobilization of enzymes and microbial cells is useful not only for the application of immobilized systems but also for the elucidation of structure-function relationships and mechanisms of enzyme reaction. The changes of enzymatic properties are considered to be caused by the following two factors. One is changes of the enzyme itself, and the other is physical and chemical properties of the carriers used for immobilization. The former involves modification of amino acid residues in the active center of the enzyme, conformational changes of the enzyme protein, and changes in the charge on the enzyme, while the latter involves the formation of diffusion layers around immobilized enzymes, steric hindrance effects, and electrostatic interactions between carrier and substrate.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

Lorsque support et substrat sont tous deux électriquement chargés, il se crée, dans l'environnement immédiat de l'enzyme, des interactions électrostatiques, attractives ou répulsives, avec pour conséquence l'établissement d'un gradient de concentration du substrat et une variation de l'affinité apparente. - Km augmente si les charges du support et du substrat sont de même signe. - Km diminue si les charges sont de signe opposé. L'élévation de la force ionique du milieu tend à rapprocher les valeurs de KM pour l'enzyme native et l'enzyme immobilisée.

OBS

Les interactions électrostatiques ne sont par les seuls facteurs conditionnant la valeur du Km. Ainsi les facteurs diffusionnels au sein du réacteur jouent un rôle prépondérant.

Spanish

Save record 7

Record 8 2010-12-23

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
DEF

Modification of enzymes, which is often, but not always, accomplished by the addition of a phosphate group to a specific serine, threonine, or tyrosine residue in the enzyme. The phosphate comes from ATP and its transfer is catalyzed by enzymes known as protein kinases... Phosphorylation alters the shape of an enzyme in such a way as to increase or inhibit its activity. The subsequent removal of the phosphate group, which reverses the effect of the phosphorylation, is achieved by a second enzyme, called a phosphoprotein phosphatase.

CONT

Nucleophilic catalysis is a specific example of covalent catalysis: the substrate is transiently modified by formation of a covalent bond with the catalyst to give a reactive intermediate. There are also many examples of electrophilic catalysis by covalent modification.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
DEF

Modulation réversible de l'activité enzymatique par la fixation covalente et transitoire de certains composés chimiques. L'exemple historique est celui des enzymes responsables du métabolisme contrôlé du glycogène. En fait, il s'agit ici du type de contrôle que peuvent exercer certaines hormones, dont la noradrénaline, sur des activités enzymatiques.

CONT

L'activité de nombreux enzymes est contrôlée, non pas par la formation de complexes entre enzymes et molécules régulatrices, mais par des modifications covalentes de l'enzyme. La plus connue de ces modifications est la phosphorylation/déphosphorylation des aminoacides hydroxylés; cette modification, catalysée dans un sens par une kinase, dans l'autre par une phosphatase, joue un rôle très important dans de nombreux mécanismes, comme par exemple la transmission de l'influx nerveux. [...] Un autre exemple de modification est [...] la transformation d'un proenzyme inactif en enzyme actif par coupure(s) protéolytique(s).

Spanish

Save record 8

Record 9 2008-10-22

English

Subject field(s)
  • Molecular Biology
CONT

Mechanism-based inactivators are substrate analogues that bind to the active site of an enzyme being accepted and processed by the normal catalytic mechanism of the enzyme. During the reaction a covalent modification of the enzyme occurs leading to irreversible inactivation.

French

Domaine(s)
  • Biologie moléculaire
CONT

[...] nous avons émis l'hypothèse que la doxorubicine fonctionne comme un inactivateur fondé sur un mécanisme de la NADPH-CYP réductase [...]

Spanish

Save record 9

Record 10 2008-09-22

English

Subject field(s)
  • Grain Growing
  • Brewing and Malting
CONT

Malting characteristics include improved peeling resistance, higher extract levels, higher enzyme levels, low wort beta-glucan, and faster modification rates.

OBS

Term used at the Canadian Grain Commission.

French

Domaine(s)
  • Culture des céréales
  • Brasserie et malterie
CONT

Les qualités maltières comprennent une résistance accrue au décollement de la balle, des taux d'extraction accrus, une plus forte activité enzymatique, un faible taux de bêta-glucane dans le moût et un taux de modification plus rapide.

OBS

Terme en usage à la Commission canadienne des grains.

Spanish

Save record 10

Record 11 2003-06-12

English

Subject field(s)
  • Genetics
DEF

In bacteria, enzyme systems that determine the acceptance or rejection (restriction) of foreign DNA which has entered the cell.

CONT

Investigation has shown that this restriction was due to bacterial enzymes that recognize specific sites on a "foreign" viral DNA and cleave that DNA. To protect its own DNA the bacterial cell makes a modification enzyme that adds methyl groups to nucleotides constituting the recognition sites for the restriction endonuclease, making them resistant to cleavage(modification-restriction system).

French

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

Système enzymatique qui détermine si de l'ADN sera accepté ou rejeté par la cellule.

CONT

Il existe chez la plupart des bactéries un système dit de "restriction-modification" codé par le chromosome bactérien, des plasmides, ou même certains bactériophages.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Genética
Save record 11

Record 12 1991-06-06

English

Subject field(s)
  • Molecular Biology
  • Biochemistry
CONT

("Unusual" means a base other than A, G, C, or U.) Many of the unusual bases differ from normal bases by the presence of one or more methyl(-CH3) groups. Most, if not all, of the methyl groups are enzymatically added after the nucleotides are linked together by 3’-5’ phosphodiester linkages. Very probably, the other unusual bases also arise by the enzymatic modification of a preexisting polynucleotide. The function of the unusual bases is not yet clear. They are not limited to alanine tRNA but occur in varying proportions in all tRNA molecules. Our only hint of their role is the fact that several unusual bases cannot form conventional base pairs. Some of the unusual bases may thus have the function of disruption double-helical hairpin regions, thereby exposing free keto and amino groups which can then form secondary bonds. Depending upon the specific bases, the free groups may form secondary bonds to template RNA, to a ribosome, or to the enzyme needed to attach a specific amino acid to its specific tRNA molecule. [Examples of those rare nucleotides are : Inosine, 1-methylinosine, N2-dimethylguanosine, 1-methylguanosine, Ribothymidine, Dihydrouridine and Pseudouridine].

French

Domaine(s)
  • Biologie moléculaire
  • Biochimie
CONT

Les deux classes de bases trouvées dans tous les mononucléotides sont dérivées de corps aromatiques hétérocycliques appelés purine et pyrimidine. La purine dérive elle-même de la pyrimidine par la fusion d'un cycle pyrimidine et imidazole. Les trois bases pyrimidiques les plus communes sont : l'uracile, la thymine et la cytosine, désignées couramment par U, T et C respectivement. Les bases puriques intervenant le plus souvent comme composantes des mononucléotides sont l'adénine et la guanine, respectivement désignées par A et G. Il existe [aussi] de nombreuses bases rares, telles que la 5-méthylcytosine, ou la 5-hydroxyméthyl-cytosine, [l'ionosine, la pseudouridine, etc...] Le rôle de ces bases rares n'est pas clair pour l'instant. Elles (...) existent en proportions variables dans toutes les molécules de tARN. Seul indice connu sur leur rôle possible, ces bases rares ne peuvent pas s'apparier de la manière habituelle. Certaines de ces bases rares pourraient donc avoir pour fonction de provoquer l'ouverture de quelques régions en épingle à cheveux de la double hélice, exposant ainsi des groupements cétones et aminés libres susceptibles de former des liaisons secondaires. Selon la nature des bases exposées, ces groupements libres pourraient former des liaisons secondaires avec la matrice d'ARN, avec le ribosome ou avec l'enzyme qui attache l'acide aminé à son tARN spécifique.

Spanish

Save record 12

Record 13 1990-01-16

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

The problem of enzyme stabilisations ... is primarily concerned with restraining the enzyme from adopting other conformations than those that are optimal for (a) mutual access of substrate to its binding site on the enzyme (b) the continued ability of the enzyme to express its catalytic activity on the substrate at its active site and (c) the ability for the product or products of the reaction to freely diffuse, or be repelled from the binding site.

OBS

There exist many cases when the use of a stabilizing polymeric carrier can dramatically affect the biological activity of enzymes : for example, their interaction with high-molecular-weight substrates or with cell surface receptors. Methods of enzyme stabilization also are available that do not require carriers, but instead depend on chemical modification or intramolecular crosslinking with bifunctional reagents.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

Les axes futurs les plus intéressants de la technologie enzymatique sont les suivants : - utilisation des propriétés non conventionnelles des enzymes; - élucidation des mécanismes moléculaires de l'inactivation enzymatique amenant au développement d'approches rationnelles de la stabilisation des enzymes; - catalyse enzymatique en présence de solvants organiques dans des conditions extrêmes; - conception de nouvelles molécules ayant des propriétés catalytiques par mutagénèse dirigée.

Spanish

Save record 13

Record 14 1990-01-16

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

The water activity exerts a strong influence on enzyme activity and stability. This phenomenon must be fully appreciated in order to analyze the effect of a compound on enzyme efficiency, and so as not to misinterpret as direct an indirect effect caused by a modification of water activity. Furthermore, from a technological viewpoint, a better understanding of this phenomenon may allow rationalization of the operation of enzyme catalysts and their improved efficiency.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'efficacité enzymatique est étonnante : ce type de catalyse multiplie par un facteur compris en général entre 106 et 1010 la vitesse d'une réaction, ce qui est énorme. Au niveau moléculaire, le problème est de savoir grâce à quels phénomènes intimes l'obtention de telles accélérations est possible. Quatre mécanismes principaux méritent d'être évoqués : les effets de positionnement et de proximité, la catalyse covalente, la catalyse acide-base, les contraintes conformationnelles.

Spanish

Save record 14

Record 15 1989-12-19

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

In many cases the presence of an insoluble or even soluble carrier matrix may become an insuperable obstacle for the enzyme to perform its function in the organism. In such cases investigators have used bifunctional reagents to stabilize enzymes by intramolecular crosslinking. As a rule these attempts have had only limited success, based on trials with many enzymes.... The matter is complicated by the fact that the bifunctional reagent can interact with the enzyme in three different ways : one point modification, intermolecular linking, and intramolecular crosslinking. The observed stabilization effect can be explained easily by a simple modification to the enzyme or by changes in the microenvironment as a result of the modification.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

L'insolubilisation des enzymes requiert (...) une "greffe" dans des conditions douces, entre R-COOH ou R-NH2 de la protéine et certains groupements réactifs du support solide. (...) Les agents du couplage enzyme-support sont en bonne règle des agents bifonctionnels, actifs dans des conditions douces (glutaraldéhyde, carbodiimides, etc.). Souvent, la liaison n'est pas effectuée en une seule étape, mais le support est d'abord activé, puis la protéine lui est fixée.

Spanish

Save record 15

Record 16 1987-05-05

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
CONT

In addition to chemical modification, altered enzymes may also be obtained in some cases by selection of mutants capable of growing on compounds structurally related to normal substrates of the wild-type organism. For instance, a change in a single amine acid in the enzyme acetamidase led to a mutant able to grow on butyramide.

French

Domaine(s)
  • Biochimie
CONT

En plus des modifications par voie chimique, des enzymes modifiées peuvent aussi être obtenues dans certains cas par sélection de mutants capables de croître sur des analogues structuraux des substrats normaux de la souche sauvage. Par exemple, la modification d'un seul acide aminé de l'enzyme acétamidase conduit à un mutant capable d'utiliser le butyramide comme substrat de croissance.

Spanish

Save record 16

Record 17 1985-03-25

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
CONT

In addition to chemical modification, altered enzymes may also be obtained in some cases by selection of mutants capable of growing on compounds structurally related to normal substrates of the wild-type organism. For instance, a change in a single amino acid in the enzyme acetamidase led to a mutant able to grow on butyramide.

French

Domaine(s)
  • Biochimie
CONT

En plus des modifications par voie chimique, des enzymes modifiées peuvent aussi être obtenues dans certains cas par sélection de mutants capables de croître sur des analogues structuraux des substrats normaux de la souche sauvage. Par exemple, la modification d'un seul acide aminé de l'enzyme acétamidase conduit à un mutant capable d'utiliser le butyramide comme substrat de croissance.

Spanish

Save record 17

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