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POLYPEPTIDE SEQUENCE [16 records]

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Alphabetical list of terms

Record 1 2013-11-15

English

Subject field(s)
  • Genetics
DEF

In genetics, the property that describes the linear relationship between the units of triplet sequence of nucleotides in DNA(or in RNA transcribed from it) and the corresponding sequence of amino acids in the polypeptide chain. However, some stretches of DNA molecules may not code for any peptide, and the final assembly of messenger RNA and DNA in higher organisms may require a considerable amount of processing, namely, deletion and splicing of selected segments.

French

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

Corrélation entre la structure linéaire du gène et la structure linéaire des protéines. Les exceptions (apparentes) sont introduites par les introns et par le cas de certains virus dont les gènes se recouvrent partiellement.

Spanish

Save record 1

Record 2 2013-09-09

English

Subject field(s)
  • Molecular Biology
  • Cytology
DEF

A 15-to 35-amino-acid-long sequence generally at the NH2 terminus of the nascent polypeptide chains of proteins that have a destination for an intraorganellar or transmembrane location.

OBS

Signal peptides are made in eukaryotes and prokaryotes, but not all the secreted proteins possess one.

OBS

Not to be confused with leader peptide.

French

Domaine(s)
  • Biologie moléculaire
  • Cytologie
DEF

Chaine peptidique d'une vingtaine d'acides aminés synthétisée au début de la traduction d'un ARN messager, destinée à être détachée de la protéine correspondante après son passage dans la citerne du réticulum endoplasmique et qui constitue un signal pour la machinerie cellulaire indiquant que cette protéine est destinée à l'exportation.

OBS

Cette séquence riche en acides aminés hydrophobes permet à la protéine de traverser la membrane du réticulum et sert de peptide d'adressage. De telles séquences sont spécifiques des protéines qui doivent être sécrétées ou insérées dans les membranes cellulaires.

OBS

Ne pas confondre avec peptide-leader.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Biología molecular
  • Citología
DEF

Tramo de 15 a 30 residuos de aminoácidos en el extremo N-terminal de una proteína, que la capacita para ser secretada (es decir, para atravesar la membrana celular).

CONT

La secuencia señal se elimina cuando la proteína se secreta.

Save record 2

Record 3 2013-01-22

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
DEF

The folding of part of a polypeptide chain into an ordered structure such as a α-helix [alpha-helix] or ß-pleated [beta-pleated] sheet; it is the result of hydrogen bonding between adjacent segments of the chain.

CONT

Secondary structure prediction has been a reasonably successful approach in polypeptide design. Choice of amino acid sequence was aimed at achieving the proposed folding and to form a sufficient number of specific non-covalent bonds with a particular ligand.

OBS

Although the term usually is applied to proteins, it can be applied to other polymers, e.g., the cloverleaf structure of transfer RNA.

OBS

The distinction between secondary and tertiary structure is somewhat arbitrary.

French

Domaine(s)
  • Biochimie
DEF

Élément structural d'une chaîne polypeptidique, qui peut adopter deux conformations principales, hélice α et feuillet ß, stabilisées par des liaisons hydrogène entre l'oxygène d'un carbonyle et l'hydrogène d'un amide, de même qu'entre les chaînes latérales des aminoacides.

CONT

Les protéines globulaires sont, en moyenne, formées d'environ 350 acides aminés et leur chaîne principale peut se replier d'innombrables façons. Le nombre de niveaux de structure différents montre à quel point la variété règne. Tout d'abord, les interactions locales entre des acides aminés voisins sont à l'origine de la formation des hélices alpha, des feuillets bêta ou d'autres types de structures secondaires; ces structures, formant des blocs assez bien définis, s'organisent en domaines; enfin la disposition des domaines les uns par rapport aux autres produit la structure tertiaire. L'existence des mêmes structures secondaires et des mêmes domaines, dans de nombreuses protéines différentes, prouve que [...] toutes ces structures semblent jouer un rôle fondamental dans l'évolution et la diversification des protéines.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Bioquímica
DEF

Conformación tridimensional que adoptan las macromoléculas, en particular los ácidos nucleicos y los polipéptidos.

OBS

Su formación resulta de la acción de fuerzas no covalentes generadas por interacciones entre residuos próximos. Algunos ejemplos son la hélice alfa y la hoja plegada beta de las proteínas y los bucles en horquilla de los ácidos nucleicos.

Save record 3

Record 4 2012-08-08

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
DEF

Sequence of amino acid residues along a polypeptide chain in a protein.

CONT

Today, the relative ease of gene sequencing is leading to an explosion in the derivation of protein primary structure by direct gene translation. This information is being stored in DNA databanks. The current problem with the design of enzymes is that we are still unable to predict reliably the three-dimensional structure adopted by a known primary structure (amino acid sequence) ... Minor changes in primary structure can result in the formation of additional intramolecular intersubunit electrostatic or hydrophobic bonds. Even a small number of these bonds can drastically increase the stability of subunit enzymes against dissociative inactivation.

OBS

It completely determines the secondary, tertiary, and quaternary structures.

French

Domaine(s)
  • Biochimie
DEF

Dans une chaîne polypeptidique, arrangement séquentiel des acides aminés dont l'enchaînement est assuré par des liaisons peptidiques covalentes.

CONT

La structure primaire de la molécule protéique [...] est la structure la plus importante et la plus spécifique : elle détermine les structures secondaire et tertiaire. [...] Les protéines thermostables, une fois déterminées leurs structures primaire et tertiaire, serviraient de modèles pour la construction d'enzymes qui pourraient alors être produites par génie génétique. Car si nous comprenions les principes qui donnent leur stabilité aux protéines, nous pourrions ne modifier que quelques résidus d'acides aminés de protéines connues pour les rendre stables.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Bioquímica
DEF

Secuencia lineal de residuos que forman un polímero, como por ejemplo, ácidos nucleicos, polisacáridos o proteínas.

Save record 4

Record 5 2012-04-18

English

Subject field(s)
  • Genetics
  • Molecular Biology
  • Biochemistry
CONT

transfer RNA. A class of small RNA's, each containing about 80 nucleotides. A tRNA molecules has two functional sites. At one of these sites, an activating enzyme adds a specific amino acid. The other functional site carries the anticodon specific for that amino acid. Each type of tRNA transfers one particular amino acid to a growing polypeptide chain as specified by the nucleotide sequence of the messenger RNA being translated.

French

Domaine(s)
  • Génétique
  • Biologie moléculaire
  • Biochimie
DEF

Acide ribonucléique de petite dimension comportant 70 à 90 nucléotides, dont la fonction consiste à porter un acide aminé spécifique pour la traduction d'un ARN messager au niveau des ribosomes.

OBS

Chaque ARNt est spécifique d'un acide aminé. [Observation reproduite avec l'autorisation de l'AFNOR.]

OBS

ARN de transfert; ARN soluble; ARNt : termes et abréviation normalisés par l'AFNOR.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Genética
  • Biología molecular
  • Bioquímica
DEF

Tipo de ARN cuyas moléculas son pequeñas, contienen de 80-100 nucleótidos, [...] formado por una sola cadena de ribonucleótidos que está doblada, [su] función es la de captar aminoácidos en el citoplasma y transportarlos a los ribosomas, colocándolos según indica la secuencia del ARNm [ácido ribonucleico mensajero] para sintetizar las proteínas.

Save record 5

Record 6 2012-03-16

English

Subject field(s)
  • Genetics
DEF

A codon that codes for the first amino acid in a polypeptide sequence.

CONT

A special transfer RNA (tRNA) recognizes this codon (AUG, or rarely, GUG) and starts the chain with the amino acid methionine (met) or rarely, valine, in the cytosol of eukaryotes or with N-formyl methionine (F-met) in prokaryotes, mitochondria, and chloroplasts. A different tRNA reads AUG as met in the middle of a chain.

French

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

Triplet qui signale le début du message génétique sur un ARNm. [Définition normalisée par l'AFNOR et reproduite avec son autorisation.]

OBS

La traduction de l'ARNm en protéine commence au codon d'initiation. [Observation reproduite avec l'autorisation de l'AFNOR.]

OBS

codon d'initiation : terme normalisé par l'AFNOR.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Genética
Save record 6

Record 7 2011-10-21

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
CONT

Optimal application of protein engineering technology will require understanding how the amino acid sequence of a polypeptide chain specifies its spatial conformation. It is now clear that polypeptide chain folding and subunit assembly proceeds through sequential pathways involving defined intermediates. The critical amino acid instructions directing these pathways appear to be dispersed through the sequence... Very similar patterns of chain folding and domain structure can arise from different amino acid sequences that show little or no homology. The immunoglobulins are a prime example of conservation of structure despite extensive differences in amino acid sequence.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
CONT

La structure tertiaire est due aux repliements des chaînes polypeptidiques, conférant à la molécule protéinique la forme globuleuse. (...) Les protéines contiennent des régions formées d'hélices [alpha], des feuillets [bêta], des régions sans structure rigide, des repliements souvent dus à la présence de proline. (...) Un aspect particulièrement critique de l'enroulement des chaînes polypeptidiques en leur conformation native est la très grande vitesse à laquelle elle se produit biologiquement.

Spanish

Save record 7

Record 8 2011-01-12

English

Subject field(s)
  • Biological Sciences
  • Biotechnology
DEF

Linear polymer of more than 10 amino acids that are linked by means of peptide bonds.

CONT

The properties of a polypeptide are determined by the type and sequence of its constituent amino acids.

French

Domaine(s)
  • Sciences biologiques
  • Biotechnologie
DEF

Molécule constituée par la combinaison d'amino-acides entre eux par des liaisons peptidiques et renferment plus de 10 amino-acides.

CONT

L'évolution de la structure des enzymes a suivi bien des chemins, mais ils sont tous marqués par un point commun : quand une structure est efficace, elle est conservée. Et, apparemment, il n'y a pas une multitude de conformations qui permette à un site protéique d'être "actif" pour une fonction donnée, ce qui fait que le résultat final de l'évolution est le même, quelque soit le point de départ. La physico-chimie nous rappelle qu'il n'y a pas lieu d'en être trop étonnés : de multiples contraintes s'exercent aussi bien au niveau des polypeptides (enzymes) qu'au niveau des polynucléotides (leurs gènes de structure), et le respect de ces contraintes bride l'évolution.

Spanish

Campo(s) temático(s)
  • Ciencias biológicas
  • Biotecnología
DEF

Polímero de aminoácidos, formado de cadenas que constan de restos de aminoácidos.

Save record 8

Record 9 1997-11-06

English

Subject field(s)
  • Biochemistry
CONT

Human endozepine, an 86 amino acid polypeptide, was originally isolated from human brain tissue as a putative ligand of the benzodiazepine receptor. Complete amino acid sequencing of the human and bovine proteins revealed significant homology with the partial sequence of diazepam binding inhibitor(DBI), a protein from rat brain. Both endozepine and DBI have been shown to elicit behavioral effects, suggesting that they function as pharmacologically-active ligands of the GABA.

French

Domaine(s)
  • Biochimie
CONT

Compte tenu de la présence potentielle du (DBI) [diazapam-binding inhibitor] et des peptides qui lui sont apparentés (habituellement désignés sous le nom d'endozépines), on s'attendait à ce que ces peptides suscitent un grand nombre d'études neurochimiques et comportementales, à l'instar des ligands endogènes des récepteurs des opiacés.

Spanish

Save record 9

Record 10 1996-09-10

English

Subject field(s)
  • Genetics
DEF

Any discrete, continuous part of a polypeptide sequence that can be equated with a particular function.

French

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

Région d'une séquence polypeptidique ou d'une séquence d'acide nucléique distincte d'une autre par sa structure ou sa fonction.

Spanish

Save record 10

Record 11 1996-05-15

English

Subject field(s)
  • Genetics
DEF

A single-stranded DNA molecule that specifies the nucleotide sequence of a stand synthesized by a polymerase molecule.

CONT

The amino acid sequence in a polypeptide chain is determined by the DNA template that directs its synthesis via a messenger RNA intermediate.

French

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

brin servant de modèle pour la synthèse d'un brin complémentaire

CONT

Cette ADN polymérase de grande pureté se révéla incapable de produire, à partir d'une matrice d'ADN bactérien, un ADN biologiquement actif. Cet échec s'explique par le fait que l'ADN extrait d'une bactérie telle que B. subtilis constitue une matrice médiocre pour cette enzyme. Une bonne matrice serait, par exemple, le chromosome naturel ayant la forme d'une boucle à double brin d'environ un millimètre de circonférence.

Spanish

Save record 11

Record 12 1989-06-16

English

Subject field(s)
  • Translation (General)
  • Biochemistry
CONT

The DNA-binding domains appear to have well-defined structural motifs : by contrast, mutational studies of the activator domains suggest a disquieting picture of a conformationally ill-defined polypeptide that can function almost irrespective of sequence, provided only that there is a sufficient excess of acidic residues clustered or peppered about. Thus, the elegant molecular machinery that so reliably controls expression of eukaryotic polymerase II-transcribed genes relies on nearly shapeless molecular components dubbed "acid blobs" or perhaps more aptly "negative noodles".

French

Domaine(s)
  • Traduction (Généralités)
  • Biochimie

Spanish

Save record 12

Record 13 1988-12-08

English

Subject field(s)
  • Translation (General)
  • Biochemistry
CONT

... ill-defined polypeptide that can function almost irrespective of sequence, provided only that there is a sufficient excess of acidic residues clustered or peppered about. Thus, the elegant molecular machinery... relies on nearly shapeless molecular components dubbed "acid blobs" or perhaps more aptly "negative noodles".

French

Domaine(s)
  • Traduction (Généralités)
  • Biochimie

Spanish

Save record 13

Record 14 1988-03-25

English

Subject field(s)
  • Genetics
DEF

The UAA sequence in mRNA. Like the amber codon, it signals the end of protein biosynthesis. The synthesized polypeptide chain is released after the incorporation of the amino acid encoded immediately before the ochre codon. Ochre is probably the natural termination codon, and the one most widely employed by all living systems.

French

Domaine(s)
  • Génétique
DEF

Séquence UAA de l'ARN messager qui indique la fin de la synthèse de la chaîne polypeptidique.

Spanish

Save record 14

Record 15 1979-07-09

English

Subject field(s)
  • Molecular Biology
CONT

The ribosome is an intricate piece of molecular machinery designed to help translate the polynucleotide sequence of messenger RNA into the polypeptide sequence of protein.

French

Domaine(s)
  • Biologie moléculaire
CONT

Le ribosome est un élément complexe de la machine moléculaire dont le rôle est d'aider à la traduction de la séquence polynucléotidique de l'ARN messager en une séquence polypeptidique de protéines.

Spanish

Save record 15

Record 16 1979-07-09

English

Subject field(s)
  • Molecular Biology
CONT

The ribosome is an intricate piece of molecular machinery designed to help translate the polynucleotide sequence of messenger RNA into the polypeptide sequence of protein.

French

Domaine(s)
  • Biologie moléculaire
CONT

Le ribosome est un élément complexe de la machinerie moléculaire dont le rôle est d'aider à la traduction de la séquence polynucléotidique de l'ARN messager en une séquence polypeptidique de protéines.

Spanish

Save record 16

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